JACS:制药界巨头默克的科学家发现了一种方法方法可以直接实现吡啶2-位氨基化

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本文主要介绍由默克的科学家发现的一种新型多功能试剂,可实现吡啶直接转化为Boc-保护的2-氨基吡啶,具有出色的位点选择性和化学选择性。同时,该新型试剂仅需一步制备,并实现200克规模的放大。此外,胺化反应条件温和,不受空气或湿气的影响,并具有良好的官能团耐受性(J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 8614-8618)。

新型多功能试剂2的合成操作(200 g):


在10 L的四口烧瓶中加入5,6二氯吡嗪-2,3-二甲腈(400.00 g,2010.2 mmol,1.00 eq),BocNHOH(294.41 g,2211.2 mmol,1.10eq)和THF(4.0 L)后,冷却至-20℃,并在30min内滴加Et3N(223.75g,2211.2mmol,1.10eq)。将所得溶液在-20℃下搅拌10min,过滤后浓缩滤液,通过硅胶上纯化后,将粗产物溶解在DCM(3 mL/g)中,缓慢加入己烷(12 mL/g)作为反溶剂,形成结晶2,再用己烷洗涤和干燥,得到2(205g,35%),为白色固体。

4a的合成操作:

向反应瓶中加入吡啶底物(3,1.0 eq),N,O-双三甲硅基乙酰胺(3.0 eq)和无水二恶烷(4mL),随后加入2(1.5 eq),将其密封在80℃加热3小时。将反应混合物冷却至室温,用冰AcOH(4mL)稀释,并立即加入Zn粉(5.0 eq),所得的浆液在室温下剧烈搅拌3小时,将混合物浓缩至干,并将产物在硅胶上纯化。

正文:

吡啶作为药物、农用化学品以及天然产物中的关键骨架,已开发出多种方法用于吡啶的修饰。如Minisci型自由基加成反应可引入碳键,同时也可通过吡啶N-氧化物或N-活化的吡啶鎓化合物引入碳或杂原子。然而,为了避免在吡啶N-氧化物化学反应中使用强氧化剂和活化剂,并在自由基反应中超越固有的位点选择性,因此,仍需开发一种新型吡啶位点选择性的官能化方法。

在已知含吡啶结构的生物活性化合物中,2-氨基吡啶作为所有治疗领域的化合物中发现的优先药效团。具查阅,2019年FDA批准的小分子的疗法中,在32种药物中有8种包含此类骨架(25%),其中包含2-氨基吡啶(5种)或2-氨基二嗪化合物(3种)(Figure 1)。因此,鉴于2-氨基吡啶的重要性,与吡啶N-氧化物和相关化学有关的挑战,以及Chichibabin反应的苛刻条件等,因此,需开发一种可将吡啶直接转化为2-氨基吡啶的条件,该条件可用于药物样分子的功能化。具体而言,吡啶无需预活化,不受空气或湿气的影响,以出色的位点选择性直接进行反应,同时能够耐受药物样分子中常见的官能团,并产生废物最少,纯化需简单,试剂廉价易得等。

基于上述的讨论,本文着手开发一种可将吡啶转化为2-氨基吡啶的通用方法。最初,作者使用本课题组前期开发的双功能试剂1(既充当吡啶环的活化剂,又充当N-O键断裂的温和双电子氧化剂)用于吡啶的反应(Figure 2A)。然而,在对多种基于氮的亲核试剂和双功能试剂库的筛选中,均未检测到目标产物。通常,亲核试剂在肟碳上发生进攻或氨基中间体发生开环。为了避免该途径,作者设计并测试了几种新型试剂,(i)与吡啶反应形成反应性吡啶鎓盐,(ii)提供氮亲核试剂的分子内传递,(iii)直接将官能化直接作用于C-2,(iv)防止开环,并最终通过N-O键断裂促进双电子氧化/芳构化。

在对几种新型的双功能试剂筛选中(Figure 2B),由于在同一分子中存在亲核试剂和亲电试剂而不稳定,或没有促进所需的反应。最后,作者通过将活化基团从氧代氯酰氯改变为缺电子的氯吡嗪,并将双电子氧化剂转化为亲核氮试剂,最终形成了试剂2Figure 2C)。具体反应过程涉及吡啶活化,氮亲核试剂分子内的传递,通过N-O键断裂和互变异构进行的重新芳构化,最终吡嗪的断裂,即可获得目标产物(Figure 2D)。

首先,作者以吡啶3a2作为模型底物,进行C-2胺化的条件研究。尽管典型的无机或有机碱导致2的分解(eq 1),但N,O-双三甲硅基乙酰胺(BSA)通过生成TMSC1清除HCl,从而促进了所需的反应。吡啶与2(1.5当量)和BSA(3当量)在二恶烷中在80℃下反应,在3 h后以几乎定量的产率形成吡嗪产物。随后,在强烈条件下(6M HCl,回流),酸介导的水解作用可裂解加成物并除去Boc基团,但苛刻的条件不切实际。最后发现,可在温和的还原条件(Zn+AcOH)下促进裂解,从而以高收率形成2-NHBoc吡啶产物4a

同时,试剂2也易制备,通过市售5,6-二氯吡嗪-2,3-二碳腈($1.35/mmol)和NBoc羟胺($0.05/mmol)制备大于200 g试剂2。根据DSC分析,纯化的2是结晶的,在空气中无限稳定,并且在固态至126℃的温度下具有热稳定性(eq 2)。

随后,作者对吡啶的范围进行了研究(Scheme 1)。当在吡啶环的4-位上具有醇、羧酸、磺酰胺、酰胺、吲哚、酚、硫醚、酯、醛等的官能团均耐受,获得产物4a-4l。然而,对于3-取代的吡啶底物,可选择性地发生官能化以形成2,3-或2,5-二取代的产物4m-4s。具有3-氟,3-溴或3-甲氧基取代基的吡啶底物优先形成2,3-二取代的产物。具有较大的官能团,如(杂)芳基、甲酯、三氟甲基、酰基,易形成2,5-二取代的产物。而喹啉仅生成1-NHBoc喹啉。

反应以0.5mmol或5.0mmol的规模进行时,获得相同收率的结果。此外,还以克级制备了含有Cbz或Ts基团(代替Boc)的试剂2衍生体,并在标准条件下以高收率促进了吡啶的C-2官能化(eq 3)。

为了进一步了解反应机理,作者进行了相关的对照实验和光谱实验。首先,在吡啶和4-CO2Me吡啶之间进行竞争反应,大约20%的转化率后表明,只有吡啶与2反应形成吡啶-吡嗪加合物(eq 4),表明弱亲核性吡啶反应慢。而在标准条件下与2-氘代-4-苯基吡啶进行反应,以测量分子内KIE,在反应结束时,观察到等摩尔量的CH和CD官能化产物(eq 5)。

为了进一步了解反应的过程,作者进行了NMR光谱实验(Figure 3)。首先,在10min内,观察到二氢吡啶类5与未反应的吡啶混合物。在室温下,二氢吡啶5通过碱介导的N键断裂进一步反应,大约90分钟后达到完全转化。发现最初提出的两性离子结构不正确,实际获得产物6(包含一个OTMS基团和一个去质子化的NHBoc基团)。同时,6可在80℃进行异构化,随后吡啶氮与Boc保护的氮净重排形成7。最后,将反应混合物在乙酸-d4中进行Zn介导的还原,从而获得产物4a以及副产物8

总结:本文开发了一种新型的多功能试剂,可将吡啶直接转化为Boc保护的2-氨基吡啶。同时,光谱实验表明,该反应涉及吡啶的活化、N-O键断、热异构化以及还原的过程。因此,该反应可作为合成2-氨基吡啶的通用合成方法。ong>



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